第六季中，故事始终以两条叙事线索展开。其中一条，他们在岛上。另外一条，他们也坐过那班飞机，但飞机没有出事，因此每个人都在岛外过着完全不同的生活。戴斯蒙发现两个世界之间的连接点，他于是一个个地去找那些曾经同机的人，用各种极端的方式让他们“回忆”起在岛上那段其实他们并没有经历过的日子。很多从不相识的人因此走到了一起，相爱，幸福地生活在一起。而在岛上，他们早就因种种缘由失去了彼此。最后，杰克在父亲的葬礼上见到这些同伴们幸福的笑脸，他也笑了。一直以来在宿命和责任中挣扎的杰克，在“醒”来的那一刻，真正解脱了。
以林远昊和林岚为代表的检察技术人员，运用先进的专业技术手段协助检察官突破疑难案件瓶颈，攻克“零口供”案件。野外碎尸案背后扑朔迷离的真相，迷雾重重的“国宝失窃案”裹挟着的利益团伙，光鲜亮丽背后，隐藏着无人知晓的龌龊与罪恶。多桩陈年旧案被逐一解决，直至最后林岚之父意外死亡的真相被揭开。三十多年的爱恨情仇，正义与邪恶的反复较量，用全新的视角解读检察机关在法治中国建设中的重大作用。
云台弟子云襄苦修十年步入江湖。在闯荡江湖的过程中，云襄结识了几位好友，逐渐体会到了友谊的温暖。舒亚男这位古怪精灵、聪慧机警的女子，更是让云襄产生了朦胧的情愫。意气风发的云襄和朋友们度过了一段快意恩仇的时光。可是好景不长，随着对昔日灭族惨案的深入调查，云襄挖出了更多骇人听闻的秘密，事态开始急转直下。他先后经历了欺骗、背叛与生死离别，又意识到曾以造福苍生为己任的云台早已堕落，云襄决定挺身而出,捍卫心中的正义，哪怕是牺牲自己也在所不惜。
15岁的“乖乖女”钱佳玥考上市重点高中，开始面临各种学习挑战，而她向邻居大哥哥、优等生肖涵的表白计划也以失败告终。干弟弟毛头聪明但总是闯祸。钱佳玥结识了性格飒爽的新朋友陈末，女孩们在友谊中成长。同时，父母们经历着亲情危机、家庭重组等一系列人生变化。陈秀娥知青返城后，因长期不在钱佳玥身边，母女有隔阂。在外婆陈老太离世时，三代母女间的情感纠葛得以化解。陈彭宇自诩精英却培养出“不争气”又叛逆的女儿陈末，在父女冲突后也意识到一代人有一代人的“使命”。要强的关爱萍下岗后独自抚养肖涵，“小老板”张启明学着和调皮的儿子毛头相处，在几经波折后和关爱萍重组家庭。时代在变，温暖的亲情不变，邻里街坊互相关照的温情不变。
新当选的美国总统亨特·富兰克林和他的家人搬进了白宫。
本剧改编自韩国电影《青年警察》，讲述了警校内智力超群的理论派优等生本间快（中岛），与性格直率、感情用事的行动派一之濑次郎（平野），性格相反的两人运用在警校所学的知识，伤痕累累地合作解决悬案的故事。
