在遥远的上古时期，拥有神秘力量的“东皇钟”被秘密封存，一分为四放于四处遗迹。如今，邪恶组织“猎影团”企图集齐神钟以掌控世界。为阻止这场浩劫，天才神探诸葛九九临危受命。她将携手两位性格迥异的伙伴——胶布与幽灵，组成精英夺宝小队，与猎影团展开一场横跨全球的夺宝竞速。从变异丛生的幽灵岛到黄沙漫天的沙漠金字塔，再到暗流涌动的都市舞会，他们必须破解千年机关，甩开致命追击，抢先集齐四块神器碎片，守护世界的和平。
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马天与邪恶李博士合作，企图发明可怕传染病毒和疫苗来大赚黑心钱，未料在一次运输意外中将未成熟的病毒扩散在城市里，此阶段的病毒会选择有犯罪基因的人做为宿主，并变异人类基因成为暴恶兽人-欧克瑟。另一方面，科学家柯国龙利用大自然的四元素（火、水、气、土）能量，发明了四套超级铠甲（火焰铠甲拿瓦、海啸铠甲茨纳米、旋风铠甲驭拏多、晶钢铠甲酷雷伏），只有自然的四元素能量能消灭反自然病毒的黒能量。随着对欲望的走火入魔以及对暴恶兽人欧克瑟研究的进展，马天有了建立欧克瑟世界的疯狂念头；所幸，以端木燕为首的一群热血青年开始介入欧克瑟案件，成功阻止马天的计划。端木燕、马阔海、萧风、柯胜、马灵灵等青年一方面以科学推理的侦探精神协助警方将欧克瑟案件侦破，另一方面即利用超级铠甲的自然能量给予违反自然的可怕欧克瑟迎头痛击。
女羽毛球部的成员猪股大喜暗恋女子篮球部的鹿野千夏学姐。他望着学姐每天自主练习时认真的身影心动不已，但随后却发现了意想不到的事情……!? 路途漫漫，情意绵绵。青春恋爱故事，在此开幕。
本季延续一辆专属于阳光森林幼儿园的人工智能校巴与小朋友们的故事。“小朋友的安全由我来守护”，每当小朋友们陷入麻烦，百变校巴都会变身消防车、警车、救护车、救援艇和飞机赶到现场出手相助。随着故事的发展，小朋友们也逐渐学会更多安全教育与情绪管理等知识。
