第六季故事为第五季结束时，萨德侵占莱克斯的身体，并灌输他跟克拉克一样的超能力，还释放一种病毒到地球。
“刑侦五探”是江北市公安局下属的一个特殊刑侦小组，拥有犯罪心理学的硕士学位的陆子政刚从警校毕业，加入刑侦五探的第一天就碰上了一桩棘手的案子，通过他对嫌疑人精准的心理分析，迅速找出了真凶，这也令其他人对他这个新来的年轻探员刮目相看。在随后的孪生姐妹遭遇车祸案，傲慢女星江城演出遭到死亡威胁案，七岁小女孩在放学途中遭人绑架案等的逐一侦破中，刑侦五探逐渐开始了解，建立起充分的信任。此时，一个不起眼的细节勾勒出五年前的一宗悬案，也许是命运安排的巧合，五人均与当年那个案子有着直接或者间接的联系，大家凭着智慧和勇气，克服了重重困难，将重出江湖的凶手捉拿归案，用实际行动证明了法网恢恢疏而不漏。悬案的侦破了却了多年的一个心结，也是刑侦五探走向成熟的一个开始，成为用智慧与汗水做好维护社会的和谐与稳定的坚实盾牌。
故事的起源在一所超级白金学院，它是四大家族为培养优秀后代而创立的，因此身为四大家族之后的F4(言承旭饰演道明寺、周渝民饰演花泽类、朱孝天饰演西门、吴建豪饰演美作)在学校里的地位便可想得知，从幼稚园、国小、高中一直到大学，学校里没有人敢反抗F4这四个霸气的大男生，直到她的出现，捣乱了这看似控制得宜的局面。她——牧野杉菜(徐熙媛饰演)一介平凡女子，带着父母(董至成饰演杉菜爸爸、王月饰演杉菜妈妈)要她飞上枝头变凤凰的梦想来到这里，在好友李真(叶安婷饰演)不小心恼怒了F4为首的道明寺，并引发杉菜为友情出头，从此展开了她与F4之间的爱恨情仇。
