在几乎整个人生中都被恶霸包围的哈罗德·凯尔普，一个雄心勃勃但经验不足的发明家，同时也是朱利叶斯·凯尔普教授的孙子，对科学还有很多要学习的地方。当他的一项实验失败后，哈罗德决定进入他祖父的科学学院，并爱上了美丽的波莉·麦格雷戈。为了给她留下深刻的印象，哈罗德获得了一种强效血清，就像《疯狂教授》（1963年）中那样，发生了一次剧烈的转变。历史是否在重演呢？
传奇故事还在继续！卡勒姆和瑞拉总算来到了魔法之地沙迪亚，开始归还龙王子阿兹回归他母亲——龙之女王的最危险的一段旅途。艾斯兰回到科塔利斯王国并登上王位，却不得不立刻面对与沙迪亚开战的压力。同时，被囚禁的艾伦在绝望中开始逐渐意识到他的新盟友：神秘的摘星精灵阿拉沃斯的真正力量。
在这一续集里，主要描写的是一群围棋少男少女们如何面对前辈们留下来的恩恩怨怨，如何面对他们的友谊，如何面对发生在他们之间的情感冲突，导演把追求理想做为了全续集的重点，细腻的人物心理刻画和情感的塑造，进一步拉近了与现代青少年生活间的距离。新的续集中除了原女棋手方百花外，还增加了开小棋馆的女主人小芸，为能参加国手大赛而女扮男妆的 “陈公子”，及日本的“小百合”，使原本钢劲硬朗甚至有些残酷激烈的故事一下平添了几分柔美几分温情。 续集把“和谐”这一主题上升到一个高度，既表现为少男少女间的友谊、棋手间的关系，又更深层次的表现为一种亦敌亦友的态度、宽广和睦的人生境界、国与国间的真正情谊。 续集在围绕小主人公江流儿成为“围棋英雄”的情节设置中，还安排了一个“野蛮”的围棋少年高手“棋鬼王”，在日本少年棋手黑木与日本新“名人”组成的围棋三人组来到了中国时，危机之中凌云寺里的江流儿和“棋鬼王”抛弃前嫌与女棋手方百花组成了新三人组，于是挑战、迎战，一场惊心动魄的围棋大战，伴随着一件件让人始料不及的事件终于爆发了
目暮警官、小兰的母亲妃英里、阿笠博士接连遭到不明身份之人的暗算。柯南追踪伤害阿笠博士的凶手，他根据几起案件现场留下的线索发现凶手按照扑克牌的顺序行凶，而且遇害者皆与毛利小五郎有关。目暮提供的线索初步揭开事情的真相，原来毛利当年任职警察的时候曾经逮捕犯下杀人罪的赌徒村上丈，当年也更因这一事件导致毛利离职以及婚姻变故。 十年后，服刑期满的村上丈出狱，开始按照扑克牌的顺序向毛利身边之人展开报复。在得知原委后，毛利努力寻找身边与数字有关的人。在这一过程中，各种惊险场面接连出现。而柯南也对案件的真相产生疑惑……
