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2025年10月3日播出。当血色月光吞噬地球的瞬间，六十亿人类集体坠入诡谲莫测的异世界。这里的空气弥漫着腐坏的气息，扭曲的异植在断壁残垣中疯长，会说话的影子、漂浮的残肢，以及无数超越认知的诡异生物，将原本生机盎然的新世界化作了人间炼狱！
这个星球上生活着不可思议的生物神奇宝贝。现在开始讲述少年小智和神奇宝贝们的相遇、冒险和战斗经历的故事。在结束了在成都地区的旅行后 小智只带上了他最先获得的神奇宝贝——皮卡丘 来到了芳缘地方。但是在到芳缘地方的途中，皮卡丘被火箭队的攻击变得异常奇怪...在AG中，小智和新加入的女主角——小遥，永远支持着小智的小刚，以及小遥的弟弟小胜，一起在芳缘地方，以及到对战开拓区旅行
SIDE6沉浸在一片安宜祥和的气氛中，这里远离战场，几乎从未发生过什么战事，驻守在这儿的联邦军的部队也并不多，这一点，并不使少年阿鲁高兴，因为他是一个军事迷，渴望看一下激烈的战斗场面。一日阿鲁正与朋友们交流时，殖民地内发生了骚动，这是由吉恩的小股侦察部队与联邦发生的冲突所引致，不久，一架受了伤的扎克（改），掠过阿鲁的上空，坠落在离他不远的林间草坪上。被击落的吉恩新兵巴尼，用自己的军衔章换取了阿鲁的摄影机磁卡，这里面记录有阿鲁从联邦的工厂里到的MS组装画面。此外，还有几日前从地球搬来的阿鲁家的邻居红发女郎克丽丝的倩影。巴尼获取的情报，引起了吉恩军的注意，他们立即组建了一支突击小队，执行破坏高达的任务。于是，巴尼所在的小队，依靠一场小规模的战斗的混乱，再度潜入SIDE6。在宇宙殖民地中，巴尼又一次与阿鲁相遇。
艾恩是一名【鉴定师】，一个只有【鉴定】才能完成的弱势职业。同辈们都叫他“垃圾收集者”并虐待他，他自不量力，过着卑微的生活。当艾恩遇见世界树之灵尤里和世界树的智慧守护者乌苏拉时，他的命运发生了巨大的变化。艾恩从尤莉手中得到灵眼，并接受乌苏拉的特别训练以掌握灵眼，实力逐渐增强。为了实现尤莉的愿望“与世界树的其他姐妹见面”，他踏上了旅程。凭借天生的善良和新获得的勇气，他克服了各种挑战。
行到水穷处，坐看云起时。雷家堡一战后，雷家家主战死，剑仙陨落，萧瑟强行使用内力导致自身生命垂危。为挽救萧瑟，众人踏向神秘的海外仙山，只为寻找那传说之中的仙人。而与此同时的朝堂与江湖之争，仍在继续。
