在发现Tarron皇室姐弟的下落后，Morando将军发动了对地球的全面入侵，企图一劳永逸地摧毁Tarron皇室，但是Morando将军似乎对Akiridion-5和地球有着更大的计划。与此同时，Aja和Krel将和他们在地球结交的新伙伴们一起抵抗Morando的入侵，并想办法修复母舰回到Akiridion-5。《天外三侠》第二季结束后，吉尔莫·德尔·托罗的《世外桃源的传说》三部曲将进入第三篇章《巫师 (暂译)》，所有角色都将回归！
《超越善恶》原本计划作为该系列的完结篇，但福克斯在最后一刻又购买了几集。因此，最后六集的动画风格有所不同。萨班在菲律宾聘请了一家工作室（简称为菲律宾动画工作室，该工作室也参与了1994年《神奇四侠》系列第二季的制作），因为制作前四季的动画工作室AKOM因其他项目正在筹备中而无法使用。
已经是第二次报考东大的景太郎（上田佑司 配音）又失败了，而他记忆中的青梅竹马此刻或许就在东大里等待着他来完成童年的约定。因此，景太郎的第三次东大征程决定了。由于家人的反对，景太郎忍痛离家出走。景太郎的外婆经营着一家名叫“雏田庄”的旅馆，这就是景太郎此次投奔的目的地，但是他不知道，此时的雏田庄已经成为了女生专用的宿舍，而他的第一次光临，就撞见了一丝不挂的住宿生成奈川奈留（堀江由衣 配音），从而引出了一个有笑有泪的爱情故事。在莫名其妙的状况下，景太郎成为了雏田庄的主人，而他所要面对的，是数十个“如狼似虎”的年轻女性。在应付她们的同时，景太郎还要保证自己“东大学生”的伪装不被拆穿，景太郎觉得，他和那个在东大等他的女孩之间的距离似乎越来越远了……
高一那年夏天，帆高（醍醐虎汰朗配音）离开位在离岛的家乡，独自一人来到东京，拮据的生活迫使他不得不找份工作，最后来到一间专门出版奇怪超自然刊物的出版社担任写手。不久，东京开始下起连日大雨，仿佛暗示着帆高不顺遂的未来，在这座繁忙城市里到处取材的帆高邂逅了与弟弟相依为命，不可思议的美少女阳菜（森七菜配音）。「等等就会放晴了喔。」阳菜这样告诉着帆高，不久，头顶的乌云逐渐散去，耀眼的阳光洒落街道……原来，阳菜拥有「改变天气」的奇妙能力……
