《香港人在广州》透过一个香港人远赴广州创业的奋斗故事，反映香港人与内地同胞由偏见至互相体谅、欣赏及支持的微妙过程。铁（郑丹瑞）本为高薪厚职、不愁衣食的香港中产阶级，却惨被公司解雇，同时妻慈（刘倩怡）又要求分居。在事业家庭皆失意下，铁毅然决定返广州收回祖屋地铺开创香水生意。铁因收铺关系，与当地白手兴家的万元户毅（黎耀祥）发生纠纷，幸得铁妻在内地的表妹风（张可颐）帮忙，始能和解。铁向歧视内地同胞，究竟他最后能否撇除偏见，成功在广州闯一番事业呢？
主线围绕第一集大结局搬来的黑人主妇“贝蒂·爱波怀特”。她在地下室建了一个牢房，关了一个看似非常危险的人。后来知道这个人其实是她的大儿子，杀了二儿子的女友，贝蒂不想让儿子被抓，又怕他继续伤人，便把他关了起来。然而，真相并非如此……至于其他几名主角，苏珊麦克分分合合纠缠不清；伊蒂和卡尔好上了，而卡尔希望跟苏珊复合；布丽沉浸在丧夫之痛中无法自拔，还要面对变态药剂师的追求；勒奈特回去工作；盖比和卡洛斯的婚姻历经一系列波折走向破裂。
故事发生在解放战争后期的重庆。宋怀珍（宋春丽 饰）奉党组织命令赴渝恢复因叛徒出卖面临瘫痪的地下组织，他利用失散多年的儿子林孝成（孙逊 饰）在敌特机关的便利，逐步接近敌人内部。宋怀珍有很传统的观念，与行事新潮的准儿媳蔚蓝（唐一菲 饰）时有冲突，但考虑到任务在身，特别是要策反牛师长和儿子起义的大局，她决定忍辱负重。1949年10月1日，中华人民共和国成立，国民党自知大势己去，决定撤退前实施摧毁重庆的“冷箭计划”，拿到这份计划成了宋怀珍的首要任务，而此时的林孝成对她的身份产生怀疑且充满敌意，宋怀珍将面临艰难的选择……
为了粉碎日军在山东的侵略阴谋，八路军组建了以营长黄鸣锋为队长的利剑特遣队，就在黄鸣锋执行任务时，找到了失踪的苏五巧，更有兰如剑、穆雪飞和柳迎春加入，利剑特遣队又壮大了起来。他们炸掉了日军的武器库，摧毁了日军一次又一次对共产党的武装围剿，炸沉了运送实验化学制剂的太和号货船。就在大家为完成任务松了口气的时候，黄鸣锋接到了上级总部传来的消息，日本军官杉木已将一批实验化学试剂运走，估计三天后将运抵前线。黄鸣锋立即率队员出发，他们劫持了一辆日军卡车，日夜兼程追赶杉木。黄鸣锋最终以自己的生命为代价，完成了任务。
云玛集团总裁卫卿和美术系毕业生周是这对正在经历异国恋的情侣因为彼此的信任危机而分手。两年后的周是重新回到卫卿的世界中却与过去大不相同，为了重新挽回周是，卫卿想尽了一切办法，两个人从最初的的矛盾重重到最终的冰释前嫌，一路上的磨难让两个人再一次看清了对方的心意，也更加确定了对彼此的感情，两个人的关系变得更加坚固。而周是的两个好朋友，也在各自的成长中有了新的收获。女神林菲菲和艺术家甯非的相处更加甜蜜，学神毕秋静和学霸李明成也成为了幸福的三口之家。
