新干线超进化研究所为了从诞生于“漆黑新干线”的巨大怪物体手中守护日本的未来，人们开发了“新干线变形机器人SHINKALION”。具备与SHINKALION较高适合率的孩子们成为驾驶员，与研究所员齐心协力，面对强大的敌人！究竟“漆黑新干线”的目的是……。孩子们能否守护日本的未来……。变身！SHINKALION！
在一个悠闲明媚的日子里，儒雅善良的读书人东郭先生牵着他的小毛驴边走边读手中的圣贤经典，甚是自在。这时，他的身后传来呼救声。那是一匹面目狰狞的狼，它正被猎人追捕，走投无路之际，恶狼请求东郭先生让自己藏在书袋中。善良迂腐的东郭先生拗不过这个家伙的请求，只得打开口袋让狼钻了进去。未过多久，猎人赶了过来，向东郭先生询问狼的去向。结果东郭先生指引了一个错误的方位。待猎人走远，恶狼从书袋爬出，却露出狰狞面孔要吃掉眼前的救命恩人。此时此刻，东郭先生悔之晚矣……
在封印的都市中被废弃的天象馆，误入其中的男人所见到的机器人少女，那是被繁星所引导的奇迹的物语。那是世界大战之后雨下个不停的世界。受到细菌武器的影响，而被人们抛弃了的最危险的城市“封印都市”。在某个百货商场的天文馆中，有一个机器人少女。她的名字是“星野梦美”。她是天文馆的解说员，1年之中只有7日运行的损坏的机器人。就这样，少女在这30年间始终相信着会有某个人到访天文馆，一个人在这个没有其他人的世界等待着。然后，在第三十个年头醒来的那天，她的面前出现了一个男人。
我要得到这个女孩！少年穿越到达的地方是什么事情都可能发生的异世界！？在诡异的网站设定游戏角色的道夫，再回神时就莫名其妙穿越来到了异世界。然而在明白这个世界的“奴隶”制度后，他决心使用设定游戏时所获得的技能，为梦幻的后宫生活展开冒险！
