继续展现ICAC如何锲而不舍，打击层出不穷的贪污舞弊罪行，不让繁荣稳定的香港因一小撮人而负上沉重的代价。《廉政行动二○○四》分为五个单元剧，分别是由贩卖外国护照改编的“终极斗智”、由解款车走私案改编的“不一样的赌注”、改编自首宗因身为公职人员行为不当而犯罪的“以权谋私”、廉署同一时间调查两宗涉及税务贪污案件的“猎户天龙”，以及综合所有公营房屋短桩案而成的“短桩”。
Jook 是一个一直梦想出版自己书籍的女孩。她决定将自己的梦想和学业结合起来，考虑和她最好的朋友 Ann 一起完成一个最终的项目——一本关于日本食物的日记。然后，完成梦想的旅程开始了，她的目的地是日本佐贺的一个小农场。但最后，Jook 意外地不得不独自去日本，因为她最好的朋友突然决定抛弃她。
威尔·斯科特是联邦调查局顶尖的密码分析师之一，他受雇破解一份高度加密的文件。他很快发现这是一份暗杀名单，这使他成为想要夺回名单的坏人的眼中钉。
故事发生在1944年，第二次世界大战接近尾声，日本帝国主义在海外的攻势也成为强弩之末。历经八年战火荼毒的中国，就此也到了生死存亡的决定时刻。中美英三国策划对日寇发动联合反击，肩负着艰巨使命的美国飞虎队王牌飞行员卡恩驾驶P-40战斗机飞临滇西上空，谁知却遭到此前获悉情报的日本空军的狙击。经过一番对决，卡恩的飞机遭到重创，他也不得不跳伞落入了滇西的密林之中。日军阳光司令部旋即派兵展开地毯式搜索，而八路军游击队、美军伞兵特遣队、国民党远征军也分别开始了营救行动。
