第六季中，故事始终以两条叙事线索展开。其中一条，他们在岛上。另外一条，他们也坐过那班飞机，但飞机没有出事，因此每个人都在岛外过着完全不同的生活。戴斯蒙发现两个世界之间的连接点，他于是一个个地去找那些曾经同机的人，用各种极端的方式让他们“回忆”起在岛上那段其实他们并没有经历过的日子。很多从不相识的人因此走到了一起，相爱，幸福地生活在一起。而在岛上，他们早就因种种缘由失去了彼此。最后，杰克在父亲的葬礼上见到这些同伴们幸福的笑脸，他也笑了。一直以来在宿命和责任中挣扎的杰克，在“醒”来的那一刻，真正解脱了。
高中生桐谷修二（龟梨和也饰）是学校里的人气王，为人八面玲珑，深受老师和同学喜爱，还有个人人称羡的女朋友真理子（戸田恵梨香饰），但事实上，他从来只是把这一切当作无聊的游戏，就像戴着假面般，说话做事全然不是出自真心。最让修二头疼的是同班的怪人草野彰（山下智久饰），说话做事全不按牌理出牌，还自称了解修二老是缠着他。某日，班里来了一位转学生小谷信子（堀北真希饰），总是面无表情沉默不语的她很快遭到了女生们的排挤和欺负，“这是个我无法生存的世界，再怎样努力也无济于事。”听到信子说出这样丧气的话，心生同情的修二和彰萌生了帮助她的念头，他们拟定了名为“野猪大改造”的计划，一步一步将信子从自闭的阴影中脱离，成为受欢迎的对象。
