由人类思想和情感产生的“电子脉冲”被用作人工智能辅助装置“Sapotama”的能量来源。在这一惊人发展的阴影下，出现了可怕的怪物。数码兽是通过消耗电子脉冲进化的生物。天马智郎在与突然从他的Sapotama中出现的月光兽相遇后，经历了一段非同寻常的经历。在与泽城京以及赏金猎人小队“黄金黎明”的其他成员一起生活期间，智郎重新下定了决心。人类和数码兽将创造出怎样的未来？
怕踢学院进入新世纪，处处充满了神奇的色彩，千奇百怪的奇遇和经历，小衰衰出人意料的表示：“每次都是你们几个人，太没意思了，我要交新朋友！”同期出演的金老师、大脸妹、庄酷、小金等人不！认！账！小伙伴的情谊怎么可能说没就没了，看来小衰衰对大家的认识还不够深刻，因此——众人要让阿衰有个深刻的认识和交流！嘻嘻嘻~世界上有千万朵，但唯有一直是独特的你！奇幻之旅中主角担当阿衰将给我们带来什么样的爆笑故事，好戏不要错过！
我要得到这个女孩！少年穿越到达的地方是什么事情都可能发生的异世界！？在诡异的网站设定游戏角色的道夫，再回神时就莫名其妙穿越来到了异世界。然而在明白这个世界的“奴隶”制度后，他决心使用设定游戏时所获得的技能，为梦幻的后宫生活展开冒险！
一切的开始追溯到1987年9月，在日本某处发生的离奇事件。事件发生之后的10多年来一直和未知的威胁对抗的火岛博士和与那岭博士组成了开发小组并在双神岛建设了研究所，著手进行地球制弹劾凰机械人的开发计划。多年后，终于完成了称之为“素体”的机械人原型机体。但是，就在这时候，主张此后的量产计画应以生产导向及效率为优先的无人驾驶机械人的火岛博士和为了防止万一机械人不听指挥发狂时的危险性的有人驾驶机械人的与那岭博士之间产生对立。经过长久激烈的争论后，火岛博士的提案因为危险性太高的理由被驳回而决定生产有人驾驶的机械人。火岛博士同时也被逐出研究所。
