香港SARS疫潮过后，人们终于从阴霾中走出来。脑外科医生程至美（吴启华饰）突然得知前女友的死讯，情绪崩溃，极度自责抑郁。法医岑雅晴（黎姿饰）伴其左右，鼓励他重新建立信心。急症室医生黎国柱（林保怡饰）结束了与女友的恋情，却卷入与骨科医生叶淘（吴美珩饰）及见习医生曾淑淇（廖碧儿饰）的三角恋中。不幸感染SARS的心脏科医生林敏智（陈豪饰）留下后遗症，为保全名声而隐瞒病情，却令病情日益恶化。妇产科医生万安生（邵美琪饰）与急症科医生向众仁（曹永廉饰）正计划共同生活，然而却因护士戴玉莹（姚嘉妮饰）的介入而面临一场情感考验。由香港无线电视制作的现代时装医务纪实电视剧《妙手仁心3》是《妙手仁心》系列的第三辑，监制戚其义与编剧周旭明的黄金组合更是精心打造此辑“妙手系列”。此辑剧集在风格上延续了前两辑经典之处，一如既往的得到医务人员协助实景拍摄，继续讲述医护人员在工作中的点滴故事。
继《白色强人》、《破毒强人》之后，又来了一部“强人”，也是同一个监制的作品。
余二两为救妻治病偷了好友老疤积蓄，老疤追债致使对方妻子意外死亡。过失杀人的老疤受到了法律的惩罚，其女儿阳馨误以为余二两全家伤害了父亲老疤。至此，阳馨心里暗藏仇恨并开启了一场复仇与赎罪的真心话杀机游戏。
银黛和吕洞宾结为夫妻，但银黛为了救吕洞宾而牺牲了自己。她的妹妹雪琼为了报复吕洞宾，不断制造祸端，但吕洞宾一一化解了她的阴谋。吕洞宾一心求道，最终在汉钟离的点化下成为了仙人。回到人间后，他化身为“剑侠”，暗中保护着曹友和曹恭两兄弟。曹友因被雪琼陷害而成为朝廷追捕的要犯，在关键时刻为了救曹恭而牺牲，被吕洞宾超度成仙。何月仙与儿子青枫和青松在失散十八年后重逢，但青枫却被雪琼迷惑，不愿与月仙相认，并设计陷害自己的弟弟。在吕洞宾的帮助下，青枫终于明白了真相，而月仙为了救子牺牲了自己，也得以成仙。八仙一起合力击败了雪琼，使天下太平。在途经东海时，意外地与龙王三太子发生冲突。于是，八仙展开了一场惊心动魄的过海之旅，各显神通，将整个故事推向了高潮。
