上一场激烈的战斗已经结束了数千年，邪恶的金翅雕被封印在高塔之内永世不得翻身，为了重新获得自由，它复活了自己的爪牙蛇妖和蝎妖，又将葫芦山炸成七块，令葫芦兄弟们四散各地不能团聚。之后，蛇妖和蝎妖奉金翅雕之命找到落单的葫芦兄弟们，决心将他们逐一消灭，以实现金翅雕统治世界的野心，葫芦山神得知了这一可怕的阴谋，复活了爷爷。就这样，爷爷踏上了寻找葫芦兄弟的旅途，而失散的葫芦兄弟们则失去了记忆。爷爷必须快马加鞭，和时间赛跑，赶在妖怪们之前找到葫芦兄弟，与此同时，已经忘记一切的葫芦兄弟是否会想起从前，担负起拯救苍生的伟大重任呢？
"在某个世界泡中，武装人偶与死士的冲突从未间断过。伴随着二者之间的冲突不断升级，世界泡的稳定性正逐渐降低。为了拯救这个即将崩坏的世界，人类成立了专门用来管理与控制人偶的组织。为了掩盖黑暗的真相，人类特地给组织取了一个非常可爱的名字——「人偶学园」……——啊哈哈，开玩笑的，怎么可能是那样呢？"
传奇故事还在继续！卡勒姆和瑞拉总算来到了魔法之地沙迪亚，开始归还龙王子阿兹回归他母亲——龙之女王的最危险的一段旅途。艾斯兰回到科塔利斯王国并登上王位，却不得不立刻面对与沙迪亚开战的压力。同时，被囚禁的艾伦在绝望中开始逐渐意识到他的新盟友：神秘的摘星精灵阿拉沃斯的真正力量。
这是一个发生在白垩纪晚期中国大陆上的故事……
广阔的太平洋上突然出现了一块新大陆圣洲。这片财富与危险并存的地带令人痴迷与疯狂，无数冒险者趋之若鹜。世界再次回到属于探险家的时代！
《雄兵连》系列是国内首部3D军事科幻题材动漫作品，《雄兵连3雷霆万钧》为该系列故事最新续作，剧情承接上一季，讲述地球与天使阵营结盟，共同对抗外星恶势力的故事。
