到这季开始时，X档案已是家喻户晓的科幻影集了。虽然仍被某些人认为太过偏激，但在金球奖艾美奖纷纷获得肯定。第四季仍是过去一贯的风格，但加入了许多穆德、史考莉的个人生活。在该季中，“黑油”“天花蜂”的出现使有关“真相”的调查变得更加坎坷而且扑朔迷离。另外一重大发展则是史考莉发现自己患有癌症，住院治疗，病情虽稳定住，但仍有危险。本季也介绍癌人的年轻时代，向观众交待他的历史。本季也包括了一集喜剧。本季结束于穆德在从阿拉斯加调查回来后对生命绝望，因而举枪自杀。
20多岁的苏典典为代表的“金童玉女”式的婚姻，经历了令人羡慕的短暂过程最终失败了；一对年轻人经历真正爱情至上的结合，大难当头考验了他们的情感；已经离了婚的中年男大款、克林顿式的事业成功者，身边女人犹如走马灯；50多岁的知识分子，重病在身的妻子和一辈子忍受寂寞的丈夫，双方都让人同情；陶然姑娘，始终不渝地追求爱情，十分阳光…… 谭小雨、陶然和苏典典都是同一家医院的护士。苏典典和在大医药公司担任经理……
