一场突如其来的神秘爆炸摧毁了X学院，X教授与Jean Gray失踪。镭射眼因此而意志消沉，领队的责任落在了野性的金刚狼的肩上。除了万磁王等一干强大敌人，金刚狼的过去也如幽魂般困扰着他。20年后，X教授从昏迷中醒来，看到的是一幅末日景象：巨大的机器人统治了世界，人类与变种人都濒临灭绝。X教授借助脑波机向现代的X战警传达指示：改变未来，拯救世界！ 事件的背后隐藏着怎样的真相？ 不请自来的白皇后又有何目的？ 金刚狼能否率领X战警力挽狂澜？
克莱门汀，前祖拉农十二弟子之一，前漆黑圣典第九席克莱门汀。 虽然对自己的实力有着绝对的自信，但为了躲避某个魔法吟唱者，她却过着逃亡的生活。另一方面，在纳萨力克，他们在安兹的命令下开始收集武道的情报……
在数万年前，梦魔(ナイトメア)想统治整个宇宙，於是派出一大堆魔兽到处侵略。有一群爱好自由的人组成银河战士团与知对抗，不过梦魔的魔兽太多，战士们一个一个倒下了，生还的只有铁面骑士(メタナイト)一个，他相信新的星星战士一定会出现，所以一直活着在宇宙中流浪。他知道DEDEDE大王有魔兽下载系统知后，就成为DEDEDE的部下，因为有魔兽的地方星星战士出现的机率较大。果然新的星星战士－－卡比乘着宇宙船飞来了，但是他比预定的觉醒时间早了两百年，所以什麼都不知道，连说话也不会，不过有很强的战斗潜能。铁面骑士要梦梦(フーム)好好照顾卡比让他成长，以便将来跟梦魔对决。
萧炎为唤醒老师药老，来到帝都参加炼药师大会，却因过人实力而被意图不轨的敌人暗算。危急关头，萧炎力挽狂澜成功夺冠，维护了加玛帝国荣誉。解开心结的萧炎，迎接即将到来的三年之约……
在远离大都会的西部荒野小镇，可爱少女桃乐丝（格蕾·德丽斯勒 Grey DeLisle 配音）和亨利叔叔（Stephen Root 配音）还有艾姆婶婶（Frances Conroy 配音）生活在一起。有些阴霾的日子里，她的心情无比失落，因为严厉的治安官高驰小姐要将她最爱的小狗托托带走。关键时刻，多亏了汤姆和杰瑞这对冤家搭档出手才总算救回托托。谁知好景不长，猛烈的龙卷风席卷小镇，桃乐丝家的房子被卷上空中，随后落在一个陌生神秘但百花盛开的美丽所在。倒霉的汤姆和杰瑞也一同到来，他们见到了小矮鼠泰菲（Joe Alaskey 配音）。泰菲讲述了众所周知的房子压死东方女巫以及西方女巫企图抢走桃乐丝那双红宝石鞋的故事。
