在第一季结尾中，Jaha自愿留在太空中，换来方舟部分人成功降落到地球上的好消息。但百子们却在成功引爆驻地打败地表人后，被抓到气象山的隔离区中……Bellamy和Finn也在与地表人的打斗中生死未卜。而这一季的故事就从气象山、原方舟人和其他地球人种展开来。
《漩涡》由帕斯卡尔和贾亚特里创作，第二季的故事以卡利帕提南小镇的一个声势浩大的迦梨女神节为背景，以资深律师兼社会活动家杰拉帕的遇害作为开始。杰拉帕律师是南蒂妮的辩护律师，他的遇害震惊了世人，萨卡里被调去接手调查并帮助他的家人。该谋杀案揭露了一些往事，它们的阴影笼罩着如今的一切。
东环市 公安局重案队正在庆祝“清网行动”取得重大胜利：将一名负案在逃多年的嫌疑人捕获归案。突然得知发生了惊人血案，一名公安民警被歹徒偷袭致重伤，身上的枪和子弹被抢走。公安局立刻派出重案队全力侦破，上级机关也派刑侦副处长高林前来督导 破案。高林会同重案队长洪顺达及从重案队调走的派出所干警许毅共同组成专案组。这三人是警校同学，生活中又有着千丝万缕的联系。他们克服了生活中相互之间的种种误会，与案犯斗智斗勇，经过大量的侦查，许毅发现案犯孙志军的父亲曾被自己的父亲抓捕入狱，确定这次是其报复 作案。三人及专案组立刻全力对孙进行追捕，通过斗智斗勇的多次较量，终将其围困在 山野间，经激烈枪战，临近退休的 干警老丁则在紧急关头为保护许毅中弹牺牲。最后许毅亲手将孙志军击毙，成功破获此案。
这座城市技术最精湛的医疗团队在拯救生命的同时，也处理着他们独特的人际关系。
一次心脏移植，把来自重庆的音乐才女夏远星和新加坡富家公子洛家恒联系了起来。洛家恒获得了夏远星的奇妙能力和部分记忆，他跟随心的指引，带着夏远星心中的歌，和同学戴映希一起来到魂牵梦萦的重庆。在重庆，他结识了夏远星的儿时玩伴于笑笑和程风铭，四个年轻人，两对跨国恋人，一颗牵引起所有人的心脏，欢笑和泪水的恋爱之旅就此展开。几经波折，洛家恒完成了“心”愿，程风鸣终于听到夏远星想要唱给他的歌，一首《星辰大海》兜兜转转，又带着洛家恒的爱回到了于笑笑身边。然而等待洛家恒与于笑笑的竟是更严峻的考验：经历了换心手术，洛家恒随时可能死亡。洛家恒不愿拖累于笑笑，远遁千里回到故乡。于笑笑赶到新加坡，在亲人朋友的爱和祝福下奔向洛家恒。洛家恒也勇敢地迎上于笑笑，用一首《你的答案》，表达身处逆境仍热爱生活的勇气，这对爱人紧紧相拥。
