这是一个开心球的世界，在这个世界有着许许多多神奇不可思议的东西。在这里生活着许许多多的开心球们，有善实践的科学家平博士、有知识渊博的鹿教授、还有天真活泼的兔小跳和可爱善良的猬小弟等等。他们一起斗智斗勇、嬉戏打闹，一起坐着平飞船去探讨世界和宇宙中的未知奥秘，小到微观世界的原子大到宇宙大爆发。没有它们做不到的，只有它们想不到：从生物学到物理学，从万有引力再到宇宙混乱论...平博士它们总能通过亲身实践把枯燥乏味的诺贝尔科学知识变得生动并且有趣易懂。
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这是一个人类理所当然拥有超能力“个性”的世界。被称为「笨久」的“无个性”少年·绿谷出久与憧憬的No.1英雄欧尔麦特相遇，被其发现绿谷隐藏的英雄资质，从欧尔麦特手中继承了“个性” One For All。笨久进入了英雄辈出的名门高中·雄英高中，以成为用“个性”拯救社会和人们的英雄为目标，和同学们一起度过了充满考验的每一天。 虽然打倒了宿敌All For One，但欧尔麦特也用尽了力量，便从职业英雄隐退。笨久继承了他的遗志，拿到了「职业英雄临时执照」，又接近了“最棒的英雄”一步。这时，笨久遇见了雄英三巨头中的一位，在职业英雄夜目爵士手下进行校外实习的三年级学生·通形未吏生。其压倒性的实力，让笨久更加向往在职业英雄事务所参加可以真正进行英雄活动的校外实习。另一边，不安分的＜Villain＞团体·死秽八斋会的年轻头领解修师，与继承了All For One意志的敌人＜Villain＞联军首领死柄木吊进行了接触。之后，在解修师的身旁，出现了一位少女的身影。 笨久与英雄候补生们即将与新的 “威胁” 进行战斗，新的 “使命” 挑战也开始了！！
猪猪侠在观看决竞球大赛中，有幸获得明星球员太阳之子签名的决竞球。从此，猪猪侠立志成为职业决竞球运动员。应聘助理教练岗位失败的迷糊与猪猪侠相遇，并与小呆呆、菲菲组成一支决竞球队伍。他们确定共同的目标——夺得联赛冠军。在与超人强队比赛中，猪猪队队员之间缺乏团队合作的弱点暴露无遗。最终大家认清自己在队中的位置，双方打成平手，惺惺相惜，约定一起进军职业联赛。迷糊带队去决竞球协会注册，并报名参加流星联赛。猪猪队开始主动向其它同级队伍挑战。每一场比赛猪猪侠让菲菲专心全力进攻，猪猪侠则接住对方每一个杀球。这让猪猪队在比赛立于不败之地，也逐渐形成自己的风格。
时空之隙开启，书院众人来到了现代课堂，新课堂新老师新朋友，可爱的小伙伴们又会产生什么样有趣的故事呢？航天知识的小剧场即将开讲啦！敲黑板！记得认真听课，科学小记者们还有很多小知识要传授给大家哦！！
《黑礁第二季》承接了第一季《黑礁》的故事内容，于2006年10月2日 - 12月18日在日本播出。
