基因石能量渐渐恢复成基因石，且显露出更强大的力量、更多不为人知的秘密。反派势必不会轻易罢休，将以更强大的姿态卷土重来。但在艰难的挑战中，普力士等人仍看到了希望：宇宙中，分散著为数不明的「变形联盟战士」，这群代表正义的首领勇士若聚集起来，将会成为一股巨流，一起勇敢地为守护地球而战！
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怪兽世界的侦探多罗邀请原作主角、怪兽猎人麻衣剑野参加武术大会，以选出下一任怪兽首相。然而，麻衣对此毫无兴趣，因为她从未经历过这样的事。麻衣的妹妹光一直在旁观，于是她介入了。于是多罗奉承光，试图让她以麻衣剑野二号的身份参加武术大会。与此同时，在世界的某个角落，怪兽们正密谋改造一个男孩，控制人类世界……
