1985年夏，赵都京剧团著名青衣筱月红年轻时的恋人何中信回来了，筱月红向丑角演员的丈夫赵明亮提出离婚，并为了孩子赵梨花的抚养权闹上了法庭。赵明亮在法庭上凭借丑角演员嘴皮子上的功夫，把自己拥有孩子抚养权的理由说得天衣无缝，博得法官认可。情急之下的筱月红，为了得到女儿的抚养权，不惜编造出女儿并非赵明亮亲生的谎言。他们的官司被一直嫉妒筱月红的剧团团长吴志强的妻子马艳丽捅给小报，一时间闹得满城风雨。
在旅行的列车上，美雪（铃木杏 饰）再次邂逅了金田一（松本润 饰），并追随于他。同伴用手中的DV记录着发生的一切。某夜，一个木偶团长不幸被害。案发后，警探发现他原本在车厢里的尸体不翼而飞，于是引起了一阵骚乱。探长决定在一家酒店暂时住下，找寻犯罪嫌疑人，金田一等人也一同前往。后来，根据案情，嫌疑人被锁定在木偶团体成员之中，探长想通过体重以缩小搜查范围。但是，一个女成员的意外死亡，却让金田一发现了隐藏的秘密，并由此揭开了一桩尘封多年的旧案真相……本片根据天树征丸的漫画改编，除上述特别版魔术列车杀人事件外，还包括以下6个事件，分别为幽灵客船杀人事件、法兰西银币杀人事件、黑死蝶杀人事件、速水玲香诱拐杀人事件、魔术的森杀人事件和露西亚人形杀人事件。
唐文宗大和初年，进士杜牧偶遇白马寺一瞎眼老僧。老僧赠他一幅迎风自鸣的老僧吹箫图。后来，这幅图却被新任宰相李德裕骗去。而阙盟等十八位乐工早已殉葬先帝，从图看似又尚存人间，这引起了当年参与预谋害宪宗的大内总管王守澄的紧张，他布置要——灭掉活口。时任淮南节度使牛僧孺掌书记的杜牧，于不知不觉间被卷入了旋涡。怀才不遇而纵情声色的杜牧，于扬州瘦西湖上结识了教坊歌女关小红，二人一见钟情互为知音，有“春风十里扬州路，卷上珠帘总不如”之概，后又发现小红所吹之箫竟与老僧所吹之箫为雌雄一对，心中惊讶之余，又增对小红亲近之情，终至一夜风流，珠胎暗结。
一九五零年初春，人民解放军解放了成都，国民党政权即将土崩瓦解。王保长所在的龙隐镇也沉浸在暴风雨来临之前的风雨飘摇中。国民党残部的威胁利诱，要王保长死心塌地的与人民为敌，永远变狗；人民政府也感化和感召，三嫂子的温情和规劝，希望他改邪归正，重新做人；一个尴尬的人物在一个特别的时代遭遇着一番传奇的命运。故事以王保长与三嫂子三次圆房，三次失败；三次上山为匪，又三次起义，直至生擒蒋县长，立下大功的经历为线索，艺术的再现了“旧社会把人变成狗，新社会把狗变成人”的深刻道理。喜剧性的展示了人性的丰富和多采。故事结尾的神来之笔，又给全剧抹上了一层淡淡的忧伤，浓浓的惆怅。
