由人类思想和情感产生的“电子脉冲”被用作人工智能辅助装置“Sapotama”的能量来源。在这一惊人发展的阴影下，出现了可怕的怪物。数码兽是通过消耗电子脉冲进化的生物。天马智郎在与突然从他的Sapotama中出现的月光兽相遇后，经历了一段非同寻常的经历。在与泽城京以及赏金猎人小队“黄金黎明”的其他成员一起生活期间，智郎重新下定了决心。人类和数码兽将创造出怎样的未来？
校园推理社拍摄的微电影剧情突然成为现实！微电影的女主角、夏驰的女友晴知突然收到神秘来信，离奇失踪。更为诡异的是，如同不曾存在过一般，除了夏驰和好友孟秦外，竟无人记得晴知这个人……为了寻找晴知，夏驰和孟秦不得不试图解开信中的谜题。他们意外发现，晴知被带入了一个名为“端脑”的游戏之中。为了找到晴知，他们闯入了游戏，在一次次智商、情商、体力、精神力甚至是性命的比拼中，逐渐接近了晴知失踪的真相，也渐渐发觉：端脑游戏，并没有想象中那么简单……
