2006 年 1 月 10 日至 2007 年 2 月 15 日在 FX 播出

被困的殖民者在新卡布里卡的赛昂人残酷统治下挣扎求生，但当卡拉狄加返回拯救人类时，这支羽翼未丰的舰队重新开始搜寻地球。赛昂人在失去对新卡布里卡的控制后，便踏上了前往地球的神秘旅程。

在神秘的南极冰层里，发掘出星际之门建造者遗弃的基地。星际之门亚特兰蒂斯小队应召执行一次冒险性最大的星际之门任务——前往遥远的天马星系。亚特兰蒂斯小队遭遇古代人类文明的袭击...包括不断威胁人类生命无处不在的新敌人——The Wraith.Elizabeth Weir博士是亚特兰蒂斯小队的队长，她是一个外交关系专家。她拥有出色的政治才能，但在军事上喜欢虚张声势，在军队里面担任少校之职。John Sheppard是一个天资聪颖的驾驶员。陆军少尉Aiden Ford担任副驾驶员，他是一个年轻热情的军官。Rodney McKay博士是一个聪明机智的天体物理学家，曾在星际之门司令部任职。飞船上还有一位朋友——Teyla，她是天马星系Arhosian人年轻漂亮的领袖，与亚特兰蒂斯小队一起跟The Wraith战斗。在新的一季中加入了许多新面孔，他们之中最引人注意的是Ronan Dex，一个为了捍卫自己的星球而与The Wraith抗争7年的天马星系人。还有地球最新型的银河战斗巡洋舰Daedalus--代达罗斯号的司令官，Steven Caldwell上校。新的一季新的冒险，Atlantis的冒险再度归来，带领你探索深奥的宇宙.

小镇Jericho不远处突发性核爆炸！之后小镇被完全与外界隔离起来，镇上的人们根本不知道这次爆炸会在身体上给他们带来什么，通过人与人之间在灾难过后的恐慌，失措和绝望反映在极致的状况下他们之间的关系！

　在前一季里面，为了摆脱仇杀，杰克（基弗·萨瑟兰 Kiefer Sutherland 饰）利用计谋脱离，隐姓埋名过着普通的生活。然而，随着前总统大卫·鲍尔默（丹尼斯·海斯伯特 Dennis Haysbert 饰），前同事米歇尔（蕾可·艾尔丝沃斯 Reiko Aylesworth 饰）和托尼（ 卡洛斯·博纳德 Carlos Bernard 饰）相继被杀，最后一位知道杰克还活着的同事克洛伊（玛丽·莱恩·莱杰斯库 Mary Lynn Rajskub 饰）也受到了死亡威胁。不得已，克洛伊拨通了杰克的电话，想找他寻求帮助。而在克洛伊和杰克见面时，杀手出现，杰克最终以不凡的伸手抓住了追杀他们的人。并从其口中逼问出，原来刺杀前总统是他们的主要任务，其他目标只是为了能将调查的矛头指向杰克，让杰克成为这次刺杀任务的替罪羊。杀掉前总统，目的也是为了灭口，不想前总统公布某些事情。那前总统到底想说什么呢？杰克不得不抛弃目前的平淡生活，再次卷入一场惊天阴谋中。

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