突袭世界的大灾难“第二次冲击”后，世界在废墟之上重建。14岁的少年碇真嗣被父亲碇元渡叫到第3新东京市。本以为能见到父亲迎接的他，却见到名为“ 使徒”的巨大生物与军队交火。危急之下，特务机关NERV的葛成美里将真嗣救下，并将其带往碇元渡所统领的NERV总部。但迎接真嗣的，却是是父亲冷酷地命令：驾驶称为“EVA”的巨大人型机器人与使徒战斗。本已表示拒绝的真嗣，看到重伤的替补驾驶员绫波丽后，决定遵从父亲的命令。就这样，从未受过作战训练的真嗣，准备驾驶EVA初号机迎战使徒。
Hiiragi七彩虹香味(刺叶桂花 na直接是)从大制药公司部分地发展独立的公司组织CRI做着调香师(perfumer)的工作。她调剂的香水里面，有几个已经被作为安全作品在世间被送出。由于那个缘故，公司给予了专用的研究室，饱享着在漂亮打扮的4LDK高级公寓的一个人的生活。但是，那样的她却有着另外的一个脸。那个脸是某秘密调查组织的首位代理商。她经常用单独行动来处理使节，连那个完美的行动风格的其中，享受一种危险，那样来显现出来。那样的她，有一日，突然hyumaritto『丁香』被送。象由于组织的命令丁香强制地组合搭档一样地被命令的七彩虹香味。一边闭口无言超过丁香的人的惊异性的能力，被那个反面不能理解的行动等一边播弄一边处理使节。
这部由平野俊宏执导的科幻机甲动作片讲述了一名年轻男子挺身而出阻止其好友的激烈战斗，好友从另一个维度召唤出了腐化武器“Doki”，并陷入狂暴。
欧文的叔叔在经营着一家以动物表演闻名的马戏团，但一场大火却让叔叔意外去世，马戏团的表演场也全部化为灰烬。此时，继承马戏团的重担落在了欧文身上，但他却显得犹豫不决，而在叔叔的葬礼上，欧文的大伯霍勒肖放话要继承马戏团和宝藏，小丑红鼻头也将一盒贴着“绝对不能吃”的动物饼干交给了欧文，令局势更加混乱……
所谓的“除妖”，即是把由于某些缘由而从原本应在的“隐世”来到“现世”停留的妖怪们送回“隐世”这一工作。某天，被妖怪附体的高中生·芦屋花绘，依靠偶然发现的联络方式，来到了专门除妖的物怪庵，在那里的是一脸不高兴的店主安倍晴斋。由于某些缘故，芦屋就这样以物怪庵奉公人的身份开始工作……安倍与芦屋的除妖组合和妖怪们的物语就此开幕。
混杂于群众之中，以人类的肉为食。拥有人类的形态，却与人类不同的存在……“喰种”。在对“喰种”进行驱逐、研究的“CCG”，曾经率领“Quinx”小组的喰种搜查官“佐佐木琲世”。他正是行踪不明的眼罩喰种“金木研”。 另一方面，在成立了新体制的“CCG”，以旧多二福为中心，不安定的行动终于表面化……与“金木研”有关的故事，终于迈向最终章——
