本季中邪恶的女王曼多拉将孔雀和罗丽抓回仙境，为救出同伴，各位主角将再次闯入仙境。女王控制的仙境更加危险，能否救出同伴我们还将拭目以待。本季中全新角色琪娜将会登场，她拥有神秘娃娃菲灵，并有着独特的战斗技能。她能否击败水王子和封银沙阻止邪恶女王的计划吗？
在进行机甲武斗大会的冠军战时，布莱札德突然来袭，十年前他们也曾侵袭而来，但不知为何他们这次就很干脆地撤退了。然后这样过了好几个月的某日，在创世纪特区的里昂一行人正要接受训练时，天空突然出现异常现象，竟然出现了镜像世界的里昂他们，这到底是怎么一回事呢？
5月15日12点《灵笼》特别篇将上线，带领观众走进未知的地面世界，揭开神秘的地面人生活。
每天入夜，当春日部的居民们酣然入睡之后，他们都会来到一个神奇而又美丽的梦中世界中。在那里，他们可以实现一切想要实现的愿望，满足一切渴望满足的要求，这个梦中的世界充满了快乐和幸福。 某日，一个名为贯庭玉崎的女孩跟父母一起搬来了春日部市，成为了这个城市中的新的一份子。然而，从那一天开始，大家就再也没有做过美梦了。那个曾经温暖的梦中世界，如今充满了痛苦、悲哀和恐惧，而梦境中的灾难亦渐渐延续到了现实之中。这一切的发生，显然和玉崎有着脱不清的干系。为了弄清事件的真相，小新（矢岛晶子 配音）联手风间（真柴摩利 配音）和妮妮（林玉绪 配音）等小伙伴们展开了调查。
[TV动画] 明日方舟 [RISE FROM EMBER] 制作确认！博士，很高兴再次见到你。
