Weir博士重获新生,McKay博士试图拯救遭受复制者攻击后早已成千疮百孔的亚特兰蒂斯。可供使用的能源仅可维持24小时,又无法使用星际之门,亚特兰蒂斯小队能否再次战胜世界末日......McKay与Sheppard计划从复制者的手中夺回ZPM。而与此同时,Samantha Carter会同Apollo正在找寻传说中遗失的城市--亚特兰蒂斯。McKay他们的计划能否成功?Carter能否找到遗失城市的所在?
2022年,拜科努尔小镇,哈萨克斯坦。在世界各国航天人的共同努力下,如今的拜科努尔发射中心已经是一片国际空间合作的热土,也是置身于哈萨克斯坦的日落黄沙景致之外的一片飞地,充满苏联太空朋克美学元素。