第六季故事为第五季结束时，萨德侵占莱克斯的身体，并灌输他跟克拉克一样的超能力，还释放一种病毒到地球。
十五年的冤狱终得昭雪，石东升（黄日华 饰）出狱后不久即要求重回警队。在曾经的好友兼搭档米安定（苗侨伟 饰）的帮助下，石东升追查到当年案件的真相并将犯罪份子绳之以法。由于十五年前自己的证词间接造成石东升的冤狱，米安定一直对石东升心存歉意，在起初发觉石东升办案过程中滥用私刑之时，米安定试图劝阻。石东升一边假意奉承米安定，另一边却利用职务之便，扮演着“地下判官”的角色。石东升越陷越深，不仅依旧无视法规我行我素，而且把米安定当成自己“替天行道”的绊脚石，想办法来陷害米安定。为了维护法律的尊严和避免出现更多的受害者，米安定决定收集证据将石东升绳之以法。
《女婿难当》讲述的是任家一家老小的故事，任大伟和女婿曾自强，处身在一个丈母娘强势的家庭之中。老少两代女婿，不但要应付种种家庭危机，还要费劲心思和强势的丈母娘斗法，和任性的小姨子斗法。尤其是围绕着怀孕、买房等问题时，女婿花招百出，丈母娘也是费尽心机。剧集虽然讲述的是家长里短的故事，但是也折射出许多社会的现实来。
剧集再现了中国航空工业70年的发展历程，以主人公秦天从英雄飞行员成长为中国第一代飞机总设计师的奋斗历程为载体，讲述与恩师杜清明、颜司令，与兄弟赵德良、张长江、江行健，与妻子曹慧芳，与红颜战友颜青，与徒弟郑国强、江战鹏、赵云飞等三代科研英雄、试飞英雄、工匠英雄和家属们，历经70年的风雨坎坷，同心协力前赴后继，让“中国制造“的飞机翱翔祖国蓝天的故事。
