悉尼与失散多年的母亲伊琳娜·德雷夫科面对面，她对女儿的意图令人不寒而栗。然而，悉尼设法逃脱，与杰克和威尔一起逃离台湾。回到洛杉矶后，悉尼继续寻找沃恩，不知道他在台北被一堵水墙卷走后是死是活。当威尔得知 SD-6 的真相和悉尼作为双重间谍的生活时，他的生活永远改变了。此外，迪克森必须决定是否将悉尼的可疑活动告知斯隆。但杰克介入并为悉尼打掩护，悉尼后来找到了沃恩，沃恩帮助她试图找到她的母亲伊琳娜，伊琳娜正在寻找一件名为“圣经”的兰巴尔迪文物。
新一季的剧情据报会偏离原作播客的内容，引入新角色及演员。Janelle Monáe饰演一名固执的女子，醒来时发现自己在独木舟上漂浮，而且失去了为何来到此处﹑以及她是谁的记忆。
1948年5月18日，身为中共中央领导人之一的零号首长在河北城南庄的临时住处遭敌机轰炸，这是国民党特务纪日辉报告给保密局长毛人凤的结果。不久，纪日辉的同学彭来峰发现了零号首长和中共中央在西柏坡。打入毛人凤身边的共产党员佟汗青请佟长缨前去西柏坡刺杀零号首长。毛人凤对佟汗青有怀疑，要佟汗青同意女儿佟长缨来保密局工作。佟汗青粉碎了彭来峰的阴谋。彭来峰逃走。毛人凤对佟长缨谎称佟汗青是被共产党杀害，派贴身保镖孙力去和她接她的家人，却暗命纪日辉派人杀害了她的母亲、弟弟。佟长缨看着惨死的至父，发誓为亲人报仇，认毛人凤为义父。中国人民共和国建立不久零号首长初访苏联，国共两党展开了刺杀和反刺杀的反复较量，直到1950年3月4日，零号首长专列顺利抵达北京。
南州交通大学文化产业管理系大一新生白宇，误闯文学院辩论社选拔现场，阴差阳错地与欢喜冤家易小曦、孙晴等人加入了沉寂多年的文学院辩论社。梦想夺取全国高校辩论赛冠军的大四学姐耿婷婷，在这支队伍身上看到了最后的希望。然而团委唐老师突然要收回辩论社训练教室，为保住训练室，婷婷签下生死状：队伍须杀入校内赛决赛。然而，一群刚入学的菜鸟辩手们，既严重缺乏辩论知识与技巧，又面临着性格不同亟待磨合等问题。一番磨砺后，这支队伍慢慢体会到了辩论的乐趣和团队的力量。一番激烈厮杀后，他们竟出人意料地晋级半决赛，最终以微弱优势战胜政法学院，成为校内辩论赛冠军。大一结束，队员们送别了毕业的耿婷婷。辩论伴随着他们这一年的成长，也让他们开始明白大学的真正价值和意义。
